El domingo 18 de diciembre de 2016, se jugó el partido correspondiente a la jornada 19 de liga contra el CD Boiro, camiseta de fútbol encuentro que concluyó con el resultado de 0-2 para el cuadro gallego y que supuso el último partido de Juan Carlos Barriocanal como presidente del Burgos Club de Fútbol. En diciembre de ese mismo año, su hijo Franco fue nombrado por la Junta General de Accionistas del Burgos CF como presidente de la institución. Los dirigentes barcelonistas alegaron presiones para su renuncia por parte del régimen franquista, amenazando los negocios personales del presidente del Barcelona. Tiene una capacidad actual de 12.642 espectadores, todos ellos sentados; y se encuentra situado junto a la ribera del Río Arlanzón. Estos equipos son el resultado de la absorción de la sección de fútbol femenino del Versalles Club de Fútbol, una sociedad avilesina de cantera principalmente. Debajo de la base, el nombre de cada uno de los ganadores anteriores del torneo está grabado. En cuanto al significado del resto de elementos; nuestros jugadores vistiendo la blanquinegra (estandarte) jugando al fútbol (balón) sobre el césped (círculo verde interior), todos ellos rodeados por el círculo exterior (blanco con bordes negros) con el nombre de nuestro club, Burgos Club de Fútbol, en su interior.
A ellas se presentaron Angélica Basurto y José Luis García con dos candidaturas bastante similares respecto a objetivos (profesionalización del club, conversión en S.A.D., ascenso a Segunda División, fundación para potenciar la cantera, creación de una ciudad deportiva, etc.) pero, entre las cuales, la de José Luis García destacaba por la experiencia y la capacidad económica de los directivos que llevaba junto a él. La eliminatoria ante el Real Valladolid se saldó con un 0-0 en la ida en El Arcángel y un 3-0 en contra en el José Zorrilla, que no empañó ni un ápice el brillante recuerdo de una de las mejores campañas de la entidad. La junta directiva del por aquel entonces Gimnástica de Burgos, se lo encargó en el año 1947. De los diferentes modelos que presentó el autor, fue elegido el conocido popularmente, el cual presenta dos modificaciones con respecto al original: el nombre de Burgos Club de Fútbol, en vez de Gimnástica de Burgos como fue concebido en primera instancia; y la corona actual, que es imitación de la del escudo de Castilla y es a modo decorativo ya que la denominación del Club como tal no integra el título de «Real». Poseen de igual manera intros y endings únicos, así como con transiciones y cartas de título personalizadas a la ocasión.
La temporada 2015/16, el equipo es dirigido por Ángel Viadero, que hace las veces tanto de entrenador como de director deportivo. El sábado 17 de diciembre de 2016 se celebraron las primeras elecciones a la presidencia del club desde su refundación en el año 1994. En todas las anteriores sólo había habido un candidato a la presidencia y ésta era la primera vez que había más de uno. A los funerales por las víctimas asistió el mismísimo Príncipe Juan Carlos en su primer viaje a Córdoba. En la Copa del Rey de dicha temporada dio una de las grandes sorpresas, llegando a los octavos de final tras eliminar al Atlético de Madrid después de vencer 2-1 en casa y dar la campanada ganando 0-1 en el Vicente Calderón, hecho que provocaría la llegada al banquillo colchonero de Diego Pablo Simeone. En categoría juvenil, el Atlético de Madrid ha sido tres veces Campeón de Campeones y otra subcampeón, cinco veces campeón de la Copa del Rey y diez veces campeón de Liga de División de Honor. En ese momento, el equipo ocupaba la 8.ª posición, por lo que logró, al menos, clasificarse para la Copa del Rey del año próximo.
Tras un año irregular y tras un gran final de temporada, el equipo acaba en 5.ª posición, pero muy alejado de los puestos de play-off de ascenso a Segunda División. Una vez más, el equipo no fue capaz de consolidarse en Primera División y en la temporada 1974-75 acabó en última posición, a muchos puntos de la permanencia, suponiendo el descenso de categoría. Tras unos inicios titubeantes, el equipo empieza a mirar a los puestos bajos de la clasificación, cayendo en la 11.ª jornada a puestos de descenso directo a Tercera División. La temporada 2018-19 es de continuo sufrimiento para el equipo que coquetea todo el año con el descenso. En la temporada 2016/17, el club sigue militando en el grupo I de Segunda División B. El entrenador para dirigir el proyecto es el mismo que acabó la temporada anterior, Ángel Viadero. Tras clasificarse para la nueva Primera RFEF, el conjunto burgalesista concluyó primero de su grupo en la última fase, lo que le valió el billete para la Fase Final por el ascenso que se decidiría, en una única sede, en Extremadura. La corona, elemento puramente decorativo, imita la propia que luce el escudo de Castilla.