↑ a b Peñarol ganó también el Campeonato Uruguayo de la FUF de 1924 y el Torneo del Consejo Provisorio de 1926; si bien Peñarol los considera Campeonatos Uruguayos, camisetas de futbol baratas no son reconocidos por la Asociación Uruguaya de Fútbol. El 10 de noviembre de 2006 es presentado el proyecto del nuevo estadio de Mestalla que se construirá en la Av. Colo-Colo cerró una de sus décadas más exitosas, ya que, en una estrecha disputa con su archirrival, Universidad de Chile (al que aventajó por solo un punto de distancia), se encumbró como campeón por vigesimosegunda vez en su historia, al ganar el torneo de ese año, que volvió a ser anual, gracias a una anotación de Francisco Rojas ante Deportes Iquique, en el Estadio Monumental David Arellano, en la última fecha. El 12 de marzo de 2008 Agustín Morera asumió la presidencia del club tras la renuncia de Juan Bautista Soler, quien seguiría como máximo accionista de la sociedad.

Inversiones Dalport no acude a la compra de acciones y Juan Soler y Vicente Soriano ven su porcentaje de acciones diluido. El 6 de julio, solo un mes después de su dimisión, Vicente Soriano asegura ser el portavoz de la empresa uruguaya Inversiones Dalport que desea hacerse con el 50,3% del accionariado del club y evitar así la ampliación de capital. La designación de Manuel Llorente no fue exenta de cierta controversia al no conocerse en aquel momento quién exactamente lo designaba presidente sin ser miembro del consejo de administración desde su destitución en 2006 por decisión de Juan Soler. Fundación Valencia CF gracias al préstamo de Bancaja, avalado por la Generalidad Valenciana, y el presidente de la entidad siguió siendo Manuel Llorente, que al mismo tiempo era uno de los patronos de la Fundación Valencia CF, contratado para un plazo de 5 años con el beneplácito de la entidad bancaria y de las instituciones, y con un salario anual de 360.000 euros. Además en esta junta se nombra un nuevo consejo de administración, con Manuel Llorente como presidente de la entidad y con José García Roig como consejero encargado de la ampliación de capital.

El propio Soler calificó la operación como un «pelotazo» urbanístico favorable para el Valencia, pero la oposición al alcalde de Ribarroja del Turia y la plataforma vecinal ecologista «Salvem Porxinos» (Salvemos Porchinos) rechazaron la viabilidad y legalidad del plan y lo llevaron ante el Tribunal Superior de Justicia. En el último partido de la temporada, el veterano lateral izquierdo Amedeo Carboni se despidió de Mestalla entre aplausos al retirarse tras 9 temporadas en el Valencia, a la edad de 41 años, 1 mes y 10 días. El 1 de agosto de 2007 se inician las obras del nuevo estadio, y ese verano el club confirma el cese de Amedeo Carboni como director deportivo tras varias discrepancias con el entrenador Quique Sánchez Flores. Este verano de 2010 el presidente destituye a Fernando Gómez como vicepresidente deportivo aludiendo motivos exclusivamente económicos, motivos que el propio Fernando desmintió. Finalmente fue el segundo máximo accionista, Vicente Soriano, quien llegó a un acuerdo por el paquete accionarial de Juan Soler, el cual nunca llegó a comprar, y nombró un nuevo consejo de administración en el que estaban, entre otros, Fernando Gómez Colomer como Vicepresidente Deportivo, convirtiéndose en el máximo responsable de la parcela deportiva en sustitución de Juan Sánchez.

Tras un inicio dubitativo, el equipo logró centrarse en su único objetivo y consiguió quedar 3.º, con Villa como goleador destacado con 25 goles. Sin embargo las lesiones de César y de Moyá convirtieron a Guaita en el portero titular y revelación del equipo. Copa del Rey cae contra el Sevilla en cuartos de final tras no aprovechar sus ventajas en el marcador y gracias a un gol del equipo andaluz en clamoroso fuera de juego en el partido de ida en Mestalla. En la Copa del Rey es eliminado en octavos de final tras dejarse remontar por el Deportivo de La Coruña una eliminatoria que ya tenía en el bolsillo, y alcanza los cuartos de final de la Europa League donde cae eliminado con polémica arbitral por el Atlético de Madrid. El Valencia volvió a quedar 3.º en la Liga, clasificándose de forma directa para la siguiente edición de la Liga de Campeones y ante la imposibilidad de alcanzar a los dos gigantes Barcelona y Real Madrid cada vez más millonarios gracias a sus contratos de derechos televisivos. Florentino Pérez. 9 de junio de 2009. Madrid. El 5 de junio se nombra como presidente en funciones a Javier Gómez, hasta entonces consejero delegado.